引起土壤缺铁的因素主要有以下几个方面：

1、土壤氢离子浓度（酸碱度），在土壤中铁的溶解度与酸碱度有密切关系，土壤越偏碱氢离子浓度﹤100纳摩/升，即PH﹥7，铁与土壤中负离子结合得越牢固，铁的溶解度也越低。试验室的实验表明，氢离子浓度每增大9倍（如1000纳摩/升，增加到10000纳摩/升），既PH每降低1个单位，铁的溶解度大约增高1000倍，所以在偏碱性土壤中生长的作物比生长在偏酸性土壤中的作物更容易表现缺铁。

2、土壤碳酸钙及粘粒的含量，土壤中碳酸钙的水解一方面能提高了土壤的酸碱度，另一方面使铁与碳酸根形成更难溶解的化合物，降低了铁的活性。此外，土壤中粘粒（土壤颗粒的直径小于0.01毫米）的含量越高，铁的有效性越低。所以碳酸钙含量越高或越偏粘的土壤，越容易出现缺铁现象。

3、土壤水的饱和度，土壤水饱和度就是土壤中含水的程度。土壤颗粒之间的空隙被空气和水蒸气所填充，如果水饱和度过高，土壤颗粒间的亏空被水填充，在还原条件下如果土壤碳酸钙含量又偏高，铁就会形成难溶解的化合物。例如：一片果园没有缺铁现象，但是一场大雨过后，积水的果园常常出现缺铁现象。在北方石灰性土壤中，这种现象更加突出，其原因就是土壤水饱和度过高降低了铁的可给性。

4、土壤有机质，土壤有机质对铁的化合有明显的促进作用，有机质高的土壤有效铁的含量也高。